纳米磁珠技术逐渐成血浆蛋白组质谱主流
10月下旬,第23届国际蛋白组学年会即HUPO2024,在德国东南部充满巴洛克风格建筑的欧洲小城的德累斯顿举办。
HUPO2024是历年来人数最多的一次,参与人数超过1800人,其中来自欧洲的参会者最多。
欧洲是世界蛋白组学的一座高峰。质谱一直是蛋白质研究的黄金标准。质谱仪通过读取离子的质荷比来识别分子。在电离蛋白质分子,将其碎裂成更小的肽并测量其质荷比后,将得到的质谱与蛋白质序列数据库进行匹配,以确定样品中存在的蛋白质的身份。
质谱蛋白组学大队列正拉开帷幕。自从2020年开始,血浆蛋白组学前处理创新逐渐走向商业化(类如Seer Proteograph™),血浆蛋白检测深度从几百个蛋白提升到几千种蛋白。随着2023年赛默飞发布最新款高分辨质谱仪Atral,血浆蛋白组学的通量也达到100SPD。开展血浆蛋白组大队列的前提已经成熟。当今蛋白组学的扛大旗人——德国马普所Matthias Mann教授。Mann组正在用Astral开展一个5万人的血浆蛋白组大队列。曾几何时,在超多重血浆蛋白组学,Seer占据非常有利的位置,一度有望成为类似于10X Genomics单细胞基因组这样的爆款。可惜由于其产品定价过高、通用性差、营销策略不当等等原因,导致其商业化进程缓慢,市场迟迟无法打开。管理层对市场反馈也基本置之不理。
这给其他公司留出了反应的时间。在HUPO2024上纷纷亮相。
瑞士老牌蛋白组学公司Biognosys和布鲁克联合推出了基于纳米磁珠技术的P2富集(https://biognosys.com/resources/truediscovery-introducing-the-p2-plasma-enrichment-system/),这种新颖的 P2 血浆蛋白质组学方法在先前发表的 5 种癌症血浆样品组中实现了 7,000 种蛋白质的蛋白质组覆盖,在布鲁克 timsTOF® HT 质谱仪上表现出最高的重现性、前所未有的低丰度蛋白质富集和无与伦比的通量。但只接受对外提供蛋白组数据检测服务,服务价格在500欧元一个样本。放在欧洲,这已经是比较便宜的价格了。
丹麦的Evosep也推出了基于纳米磁珠富集的血浆蛋白组学方案(https://www.evosep.com/applications/plasma/),联合他们的Evosep液相设备,可以实现超过3000种的血浆低丰度蛋白组检测。
德国的PreOmics 蛋白组前处理公司,顺势推出了自己版本的纳米磁珠富集产品(iST-Enrich https://www.preomics.com/products/enrich-ist),加入了这场战役,可以实现超过2000种的血浆低丰度蛋白组检测。
在中国,也有纳米磁珠专家进入蛋白组学领域,其中厦门普睿迈格生物科技有限公司依托自己强大的磁珠表面修饰技术,也推出了多种纳米磁珠富集血浆血清的产品(http://www.purimagbead.com/Product/8096211554.html),可以实现近4000种的血浆低丰度蛋白组检测。此外,来自芝加哥大学的 Nanomics 珞米生命科技、来自复旦大学的邓春晖教授/百趣生物,也在该领域不断开拓。
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