15年前中国大部分的 实验室都还在使用酚氯仿抽提核酸，用户以为核酸纯化试剂盒都是来自国外的进口产品。  

      15年过去了，现在的分子生物学实验室酚氯仿抽提基本消失，Trizol试剂是硕果仅存，尚有普遍使用的酚氯仿核酸提取方法。还有一种方法是煮沸法，其原理是先加热变性蛋白，再离心去沉淀蛋白，最后取核酸上清。但是煮沸法本质上并未进行核酸纯化，只是把蛋白变性沉淀下来而已，因此它的缺陷也显而易见：核酸片段短，抑制物含量高，应用范围仅局限在PCR检测中--以扩增检测几百bp的目的片段为主，如果你想P一个5kb的基因，煮沸法提取的核酸几乎不可行，因为大部分核酸都已经降解成1-2kb以下的小片段了, 适合扩增的长片段模板含量太低。

      目前主流的核酸纯化方法只剩磁珠法和硅胶柱法了。那么应该选择磁珠法还是硅胶柱法呢？硅胶柱技术的厂家说磁珠法得率低，纯度差，效果不好；磁珠法厂家说硅胶柱法即将被淘汰，童靴们都糊涂了，到底咋回事？

      其实磁珠法和硅胶柱法原本是一家。Marko在1982年发表的文献：A procedure for the large-scale isolation of highly purified plasmid DNA using alkaline extraction and binding to glass powder. Anal. Biochem.121, 382-387，里面详细描述了如何用玻璃粉吸附DNA，并进行纯化的过程。

      玻璃的主要成分就是二氧化硅，磁珠只不过是在四氧化三铁的微球表面涂上一层二氧化硅（玻璃介质）而已。具体原理是什么呢？说实话小编也不是很清楚，据说核酸溶液是一种胶体溶液，外层有水化层和电荷层，水化层或是电荷层被夺走后就变得粘稠了--大家可以想象一下酚氯仿抽提后的水相，加醇了以后，界面出现了粘稠的核酸，可用玻璃棒粘走核酸--大概就是核酸的水化层被剥离后变得粘稠了，从而黏附到玻璃介质上了，看来玻璃（SiO2)确实是黏附核酸的好东东。

      极小的玻璃球就是玻璃粉或者是磁硅珠。一切似乎都很完美，可问题是，如果核酸太多了一点，就会把玻璃球黏在一起，紧密黏在一起的小团不仅黏住了残留的蛋白，还滞留了盐分，怎么解决？

      把玻璃棒拉细，超级细，直到变态细，就做成了玻璃纤维。把玻璃纤维叠个N层，当然还是疏松的，却不会像玻璃珠那样堆积在一起。于是蛋白不容易黏上，盐分也容易清洗掉了----这个就是做在纯化柱中的硅胶膜。

      这么说，硅胶柱法应该是玻璃粉法的升级版了？实测确实如此，硅胶柱法纯化核酸的纯度，回收效率都优于玻璃粉法。

      随着分子生物学的不断发展，要求全自动提取基因提上日程，大批量处理样本的医疗机构用户（那可是有钱人哦）对自动化的要求日益迫切。硅胶柱法需要高速离心机（大于10000g以上），其在自动化操作上异常困难，加载有硅胶柱的自动化核酸纯化仪器非常复杂，比如QIAGEN的QIAcube全自动核酸纯化仪 ，就整合了离心机、加热震荡器、移液体系和自动抓取器，虽然完整地延续了硅胶柱法的高纯度和高回收率的优势，但仪器价格昂贵，应用受到限制。

      于是磁珠法应运而生，在磁珠表面包上一层二氧化硅，替代传统的玻璃粉法，就可以实现磁场分离替代离心分离的作用，很容易实现仪器上的操作自动化，但是磁珠法仍然存在玻璃粉法的缺陷，提取的核酸纯度低、盐分残留高。

      因此，硅胶柱法不会消失--特别是科研用户，并不需要大批量的样本进行核酸纯化，更关注的是核酸的回收效率、纯度，这些却是磁珠法的硬伤。磁珠法更适合于低浓度核酸的提取，为了提高核酸提取的纯度，对磁珠表面改造也是重要的发展方向。