Protein A磁珠, Protein G磁珠, Protein L磁珠, Protein A/G磁珠, Protein A/G/L磁珠的抗体结合能力比较
Protein A、Protein G、Protein L、Protein A/G和Protein A/G/L常被固定到磁珠上,用来亲和纯化免疫球蛋白,Magarose系列蛋白磁珠是纯化大多数免疫球蛋白的理想工具。不同的蛋白对不同来源的抗体亲和能力是有差异的,为便于用户了解和选择相应系列蛋白磁珠,下表列出了Protein A、Protein G、Protein L、Protein A/G和Protein A/G/L分别与不同免疫球蛋白的亲和能力。对于免疫球蛋白(Ig)抗体捕获磁珠,Protein A、G、L 以及 A/G、A/G/L 的核心区别并不是“谁的容量一定更高”,而是对不同抗体亚型、物种以及轻链类型的结合谱不同。
| 磁珠类型 | 主要结合位点 | 典型结合对象 | 结合谱 | 推荐程度 |
|---|---|---|---|---|
| Protein A | Fc区 | 人/兔 IgG 等 | 中等偏广 | ⭐⭐⭐⭐ |
| Protein G | Fc区 | 人/鼠/兔等 IgG | 通常比A更广 | ⭐⭐⭐⭐⭐ |
| Protein L | κ轻链 | 含κ轻链抗体 | 不依赖Fc | ⭐⭐⭐⭐ |
| Protein A/G | Fc区 | A和G均能结合的IgG | 非常广 | ⭐⭐⭐⭐⭐ |
| Protein A/G/L | Fc + κ轻链 | 大多数IgG及部分Fab/F(ab')₂ | 最广 | ⭐⭐⭐⭐⭐ |
这里需要特别注意:Protein L不是Protein A/G的简单“升级版”。Protein L主要识别抗体的 κ轻链,因此它能够结合某些不含完整Fc的抗体片段,而Protein A/G主要依赖Fc区域。
1. 蛋白 A (Protein A)
Protein A(SPA)是来源于**金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)的细胞壁表面蛋白,也是目前抗体纯化和免疫捕获中最经典的亲和配基之一;其核心特征是含有多个高度同源的 IgG-Fc结合结构域(E、D、A、B、C),这些结构域主要通过α-螺旋三束结构形成稳定的Fc结合界面,与哺乳动物的IgG结合,天然的Protein A,42kDa,含有四个Ig Fc结合位点,其中2个是有活性的,而用于纯化抗体的,一般是重组的protein A,含有4个Ig Fc区域结合位点。
蛋白A作为亲和配基被偶联到琼脂糖基质上即蛋白A琼脂糖(protein A agarose),可以特异性的和样品中的抗体分子结合,而使其他杂蛋白不结合,具有极高的选择性。1个蛋白A分子至少可以结合2个IgG。天然蛋白A 和重组的蛋白A对于IgG的Fc段有着相似的特异结合。但重组的蛋白A经改造后含有一个C末端半胱氨酸,可以单一位点偶联于琼脂糖上,降低了空间位阻,增加了与抗体的结合能力。蛋白A与IgG的结合强度很大成度上依赖于该抗体的种属和亚型,蛋白A琼脂糖常用于免疫沉淀鼠 IgG2a, IgG2b, IgA, 兔 IgG, 以及人的 IgG1, IgG2和IgG4几种抗体。

2. 蛋白G (Protein G)
Protein G(蛋白G)是抗体亲和纯化中与 Protein A 齐名的经典 Fc 结合配基。它来源于链球菌属(Streptococcus),能够通过特异性结构域结合免疫球蛋白的 Fc 区域,尤其适合捕获多种哺乳动物来源的 IgG。蛋白G分子量25kDa,为三型Fc受体。蛋白G可以与IgG的Fc 区域特异性结合,与Protein A相比对IgG具有更好的结合能力,血清蛋白结合水平更低,纯度更高,配基脱落也相对更低。天然 Protein G 是链球菌表面的免疫球蛋白结合蛋白。它除了具有 IgG-Fc 结合能力外,天然蛋白还具有其他结合功能;而商业化 Protein G 配基通常使用经过工程化的 Fc-binding domain,而不是完整天然蛋白。重组蛋白G已经除去了与白蛋白及细胞表面结合位点,减少了交叉反应和非特异性结合。因此,它比天然蛋白G和蛋白A有更大的亲和力。
蛋白G作为亲和配基被偶联到琼脂糖基质上即蛋白G琼脂糖(protein G agarose),可以特异性的和样品中的抗体分子结合,Protein G能结合所有的人和鼠的IGG抗体亚型,包括鼠的IGG1。Protein G也可以与小鼠的IGG2a和IGG2b结合,而Protein A则不能。

3. 蛋白 L (Protein L)
Protein L是一类来源于乳酸杆菌属(Peptostreptococcus /相关细菌)的免疫球蛋白结合蛋白,分子量36Kd;天然Protein L通常含有多个轻链结合结构域,而商业化的重组Protein L通常选用其中的功能结构域进行工程化。它最大的特点是:不需要抗体Fc区,也能结合抗体;其主要识别:Ig κ轻链的可变区(VL)附近结构。因为重链的任何部分都不会参与结合相互作用,蛋白L结合更宽范围的抗体类大于蛋白A或G蛋白L结合所有抗体类,包括IgG,IgM,IgA的,IgE和IgD的代表。尽管有很宽的结合范围内,蛋白质L不是一个通用的抗体结合蛋白。 L蛋白结合仅限于那些含有κ轻链的抗体,在人类和小鼠抗体,抗体分子除了包含κ轻链,其余有ι轻链。例如,它结合人VκI,VκIII和VκIV亚型但不结合VκII亚型。

4. 蛋白A/G (Protein A/G)
Protein A/G通常不是天然存在的一种独立蛋白,而是将 Protein A 和 Protein G 的 IgG-Fc 结合结构域进行人工重组/融合设计得到的双功能重组蛋白。
Protein A/G是什么?
Protein A:来源于金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus),天然含有多个 IgG-Fc 结合结构域。
Protein G:来源于链球菌(Streptococcus),具有 IgG-Fc 结合结构域。
Protein A/G:把 Protein A 和 Protein G 中具有功能的 Fc-binding domains 组合到同一个重组蛋白中,从而扩大对不同物种、不同 IgG 亚型的结合范围。
需要注意,不同供应商的 Protein A/G 并没有完全统一的结构。有些产品是 A 和 G 的多个结构域串联,有些则只选择其中具有较高亲和力的结构域。

5. 蛋白A/G/L (Protein A/G/L)
Protein A/G/L 可以理解为一种把 Protein A、Protein G 和 Protein L 的抗体结合功能组合到同一个重组蛋白中的“超广谱抗体结合配基”。不过要特别强调:Protein A/G/L并不是一个天然存在、结构完全统一的蛋白;不同厂商的重组Protein A/G/L在结构域数量、排列和Linker设计上可能不同。也就是说,它实际上组合了两种不同的抗体识别机制:Protein A/G → 主要识别抗体 Fc;Protein L → 识别免疫球蛋白轻链,尤其是κ轻链相关结构。

表2. 蛋白识别区域简单对比
配基
主要识别区域
完整IgG
Fab
F(ab')₂
scFv
Protein A
Fc
★★★★★
—
—
—
Protein G
Fc
★★★★★
—
—
—
Protein L
κ轻链相关区域
★★★
★★★★★
★★★★★
★★★★
Protein A/G
Fc
★★★★★
—
—
—
Protein A/G/L
Fc + κ轻链
★★★★★
★★★★★*
★★★★★*
★★★★*
表3. 蛋白识别对象位点详细比较
|
|
|
Protein A | Protein G | Protein L | Protein A/G | Protein A/G/L |
| Human |
IgG |
+++ | +++ | +++ | +++ | +++ |
|
|
IgG1 |
++++ | ++++ | ++++ | ++++ | ++++ |
|
|
IgG2 |
++++ | ++++ | ++++ | ++++ | ++++ |
|
|
Ig3 |
|
+++ | +++ | +++ | +++ |
|
|
IgG4 |
++++ | ++++ | ++++ | ++++ | ++++ |
|
|
IgA |
+ |
|
+++ | + | ++++ |
|
|
IgA1 |
+ |
|
+++ | + | ++++ |
|
|
IgA2 |
+ |
|
+++ | + | ++++ |
|
|
IgD |
|
|
+++ |
|
++++ |
|
|
IgE |
++ |
|
+++ | ++ | ++++ |
|
|
IgM |
+ |
|
+++ | + | ++++ |
|
|
Fab |
+ | + | +++ | + | ++++ |
|
|
ScFv |
+ |
|
+++ | + | ++++ |
| Mouse |
IgG |
++ | ++ | +++ | +++ | ++++ |
|
|
IgG1 |
+ | ++++ | +++ | +++ | ++++ |
|
|
IgG2a |
++++ | ++++ | +++ | ++++ | ++++ |
|
|
IgG2b |
+++ | +++ | +++ | +++ | +++ |
|
|
IgG3 |
++ | +++ | +++ | +++ | +++ |
|
|
IgM |
|
|
+++ |
|
+++ |
| Rat |
IgG |
+ | ++ | +++ | ++ | +++ |
|
|
IgG1 |
|
+ | +++ | ++ | +++ |
|
|
IgG2a |
|
++++ | +++ | +++ | ++++ |
|
|
IgG2b |
|
++ | +++ | + | +++ |
|
|
IgG2c |
++ | ++ | +++ | +++ | +++ |
|
|
IgG3 |
+ | ++ | ? | ++ | ++ |
| Horse |
IgG |
++ | ++++ | ? | ++++ | ++++ |
|
|
IgG(ab) |
+ |
|
? | + | + |
|
|
IgG(c) |
+ |
|
? | + | + |
|
|
IgG(T) |
|
+++ | ? | +++ | +++ |
| Goat |
IgG |
++ | +++ |
|
++++ | ++++ |
|
|
IgG1 |
+ | +++ |
|
+++ | +++ |
|
|
IgG2 |
+++ | +++ |
|
+++ | +++ |
| Guinea-pig |
IgG |
+++ | + | ? | +++ | +++ |
|
|
IgG1 |
++ | + | ? | ++ | ++ |
|
|
IgG2 |
++ | + | ? | ++ | ++ |
| Sheep |
IgG |
+ | ++ |
|
+++ | +++ |
|
|
IgG1 |
+ | ++ |
|
+++ | +++ |
|
|
IgG2 |
+++ | +++ |
|
+++ | +++ |
| Cow |
IgG |
+ | +++ |
|
+++ | +++ |
|
|
IgG1 |
+ | +++ |
|
+++ | +++ |
|
|
IgG1 |
++ | +++ |
|
+++ | +++ |
| Rabbit |
IgG |
+++ | +++ | + | +++ | +++ |
| Cat |
IgG |
+++ | + | ? | + | +++ |
| Dog |
IgG |
++ | + | ? | +++ | +++ |
| Pig |
IgG |
+++ | ++ | +++ | +++ | +++ |
| Chicken |
IgY |
|
|
|
|
|
| Monkey |
IgG |
++++ | ++++ | ? | ++++ | ++++ |
| Hamster |
IgG |
+ | ++ | +++ | ++ | ++ |
| Koala |
IgG |
|
+ | ? | + | + |
| Llama |
IgG |
|
+ | ? | + | + |
| Donkey |
IgG |
++ | +++ | ? | +++ | +++ |
注:数据条长度表示Protein系列蛋白和抗体的相对结合强度;Protein L仅和具有Kappa轻链的上述抗体结合;?代表无数据支持,不明结合能力。
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