武汉大学和北京大学国家重点实验室采用链霉亲和素磁珠捕获DNA探索DNA主动去甲基化新途径。

摘要：可以通过十一个11易位（TET）双加氧酶介导的5mC氧化为5-羟甲基胞嘧啶（5hmC），5-甲酰基胞嘧啶（5fC）和5-羧基胞嘧啶（5caC）来实现5-甲基胞嘧啶（5mC）的主动去甲基化由胸腺嘧啶DNA糖基化酶（TDG）启动的碱基切除修复（BER）。 TDG-BER途径可能导致DNA链断裂的产生，从而可能损害基因组完整性。另外，TET产生的5caC的直接脱羧具有很高的吸引力，因为这种机制允许5mC转化为胞嘧啶而不会形成DNA链断裂。然而，人类细胞中5caC中C–C键的裂解仍是一个悬而未决的问题。我们使用携带5caC的发夹DNA底物在细胞提取物和活细胞中检查了该反应。与全细胞蛋白质提取物一起温育或转染到人类细胞中后，我们使用液相色谱-串联质谱（LC-MS / MS）分析在单核苷酸和寡脱氧核苷酸水平上通过直接脱羧或BER监测了5caC向胞嘧啶的转化。我们的结果清楚地表明，人类细胞中5caC可以直接转化为胞嘧啶，为支持DNA主动去甲基化的新途径提供了证据。

https://www.chinesechemsoc.org/doi/full/10.31635/ccschem.020.202000286

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