【产品介绍】
本试剂盒是用来从叶子、种子等植物组织和植物培养细胞等植物样品中快速提取和纯化植物基因组DNA。本试剂盒是利用磁硅珠能吸附破碎溶液中的基因组DNA 的原理来回收DNA。无需借助苯酚等有害的试剂来进行除蛋白操作,就能简便地抽提出基因组DNA。回收的DNA 可以直接用于下游进行酶切、PCR、二代测序和基因芯片等分子生物学实验。本试剂盒除可与核酸自动抽提装置组合使用外,还可与磁分离架一起使用,作为进行固液手动分离的试剂盒。
【特点】
l 高效率:可以从叶子、种子等组织和培养细胞等植物样品中抽提出高纯度的基因组DNA。
l 简便/短时间:利用磁硅珠对基因组DNA 的吸附性,能简便地在短时间内抽提出基因组DNA。
l 可进行高纯度的DNA 抽提: 本试剂盒抽提的基因组DNA,几乎不含RNA 和蛋白质等杂质,可直接用于PCR 等的酶反应。
【保存方法及注意事项】
1) 裂解液低温储存可能会出现白色絮状漂浮物,在使用前65℃预热至白色絮状物完全溶解,不影响使用效果。
2)磁珠使用前要充分混匀。
3)如果下游实验对RNA污染比较敏感,可在裂解时加入1ul 的RNaseA (10mg/ml)。
4)如果是干材料,适当延长裂解时间,种子用粉碎机打成粉末状使用,样品为种子时,裂解时间为30min。
5)如果同等取样量下欲得到更多DNA可增加洗脱次数(洗脱次数最好不要超过3次),也可适当延长裂解时间。
【试剂盒组成】
组分
100次
保存
Lysis Buffer
50 ml
常温
PuriMag bead
2 ml
2-8℃
Wash buffer
75%乙醇(用户自备)
Elution buffer
5 ml
RNase A
2 ml(选配试剂)
异丙醇
用户自备
DNA浓度及纯度检测 :(1)得到的基因组DNA片段大小与样品保存时间、操作过程中剪切力等因素有关,所得DNA片段可用琼脂糖凝胶电泳和紫外分光光度计检测浓度和纯度。 (2)DNA应在OD260处有显著吸收峰,OD260=1相当于大约50ng/ul双链DNA,40ng/ul单链DNA。OD260/OD280比值应为1.7~1.9,如果洗脱时使用去离子水,比值会偏低,因为pH和离子会影响吸光度,并不表示纯度低。
【操作步骤】
取材量参考下面表格:
材料
取样量
新鲜植物叶片
50~200 mg
干叶片
10~30 mg
大豆种子
5~30 mg
小麦种子
玉米种子
以从50 mg~200 mg植物叶片中提取基因组DNA为例:
1)取新鲜植物组织或粉状干燥组织50mg~200mg,用液氮在研钵中研磨充分,加入1ml的Lysis Buffer(65℃预热)研磨均匀,然后转移到1.5ml的EP管,混合均匀。
2)将EP管置于恒温水箱中65℃温浴30~60min,期间不时摇动,温浴结束后,12000rpm离心10min。
3)取200ul上清液于新的1.5ml的EP管中,加入20ul 的RNA酶混匀,5min后加入20ul的 PuriMag bead、200ul异丙醇,颠倒混匀静置5min后,将EP管置于磁力架上磁分离,吸弃上清液。
4)移去磁力架,加入800ul的Wash Buffer,振荡混匀静置5min后,将EP管置于磁力架上磁分离,吸弃上清液。若有团状或丝状物可增加振荡时间及力度。重复该步骤一次。
5)移去磁力架,加入100ul的Elution Buffer,移液枪缓慢吹打混匀1~2min,将离心管在磁力架上静置0.5min,小心吸走上清液放入新离心管即为提取的DNA,存放于2-8℃,长期存放需置于-20℃。(洗脱液在65-70 ℃中预热后洗脱效果更好,减小洗脱体积或多次洗脱可增大DNA浓度。)
【常见问题即处理建议】
常见问题
可能的原因
建议
得率
样品没有研磨充分
尽量将样品研磨充分
样品裂解完后,没有离心直接进行下一步操作
如样品裂解后,一定要离心后,再进行下一步操作。
样品用量过大
严格按说明书程序进行
程序设置不准确
条带弥散
研磨时间太长
迅速研磨防止DNA降解
环境温度太高
可将研钵置于-20℃预冷20min后再进行研磨,如所提材料基因组极易降解,用液氮研磨
样品不新鲜或样品反复冻融多次
尽量用新鲜样品试验
裂解时间太长
裂解时间不超过60min